公元830年，科班城浩大的工程突然宣告停工，在公元835年，帕倫克的金字塔神廟也停止了施工。公元889 年，提卡爾正在建設的寺廟群工程中斷了。公元909年，瑪雅人最后一個城堡，也停下了已修建過半的石柱。這情形令我們聯想到復活節島采石場上突然停工的情景。這時候，散居在四面八方的瑪雅人，好像不約而同地接到某種指令，他們拋棄了世代為之奮斗追求，辛勤建筑起來的營壘和神廟，離開了肥沃的耕地，向荒蕪的深山遷移。

　　現在我們所能看到的瑪雅人的那些具有高度文明的歷史文化遺址，就是在公元8世紀至9世紀間，瑪雅人自己拋棄的故居。如今的游客倘佯在這精美的石雕和雄偉的構架面前，無不贊嘆、惋惜，而專家學者們卻陷入了深深的困惑之中。

　　瑪雅人拋棄自己用雙手建造起來的繁榮城市，卻要轉向荒涼的深山老林，這種背棄文明、回歸蒙昧的做法，是出于自愿、還是另有其他原因？

　　史學界對此有著各種解釋與猜測。譬如說：外族侵犯、氣候驟變、地震破壞、瘟疫流行，都可能造成大規模的集體遷移。然而，這些假設和猜測都是缺少說服力的。首先，在當時的情況下，南美大陸還不存在一個可以與瑪雅對抗的強大民族，因此，外族侵犯之說就站不住腳。氣象專家幾經努力，仍然拿不出公元8 世紀至9世紀間，南美大陸有過災難性氣候驟變的證據，同樣，瑪雅人那些雄偉的石構建筑，有些已倒塌，但仍有不少歷經千年風雨卻依然保存完整，因此地震災難之說可以排除。至于瘟疫流行問題，看來很有可能。然而，在瑪雅人盤踞的上萬平方公里的版圖內，要大規模地流行一場瘟疫，這種可能性是很小的。再說瑪雅人的整體遷移，先后共歷時百年之久，一場突發性的大瘟疫，絕無耗時如此長久的可能性。

　　于是，就有了后人的種種猜測??

　　有人認為瑪雅文化的神秘消失是由外星人運用大型太空船集中人力、物力進行突擊性的運送來完成的星球大轉移。太空船把絕大多數瑪雅人運送到外星球后，只有極少數人留守。當這些留守者眼睜睜地看著自己的親人離家而去、遷往遙遠的新天地時，就會注視著天空，發出“啊咿啊咿” 的叫喊， 似乎在向運送他們親人的太空船叫道： “等一等呀，帶著我啊！”這個猜測倒是與出土文物上瑪雅人仰天呼號的形象頗為合拍。根據瑪雅人神秘的生活方式和奇詭的科學成就，認為是一種有計劃、有目的、有步驟、有安排的向外星球的移民行動，似乎也有一定的合理性。根據有關資料，有的學者認為，在大西洋中曾有一個大西洲，它經濟繁榮，文化發達，可在1萬多年前的某一天，它一夜之間沉入了大海，毀滅了。翻開地圖我們發現，大西洲的位置離猶卡坦半島很近。德國科學家莫克認為，瑪雅人在公元前8499年6月5日13 時開始了他們的新紀元。在瑪雅人中流傳著這樣一句話“世界由5個太陽主宰，一個太陽代表一個紀元”。所以我們認為，若以上材料是真實可靠的話，那么，也許瑪雅人會是幸存的大西洲人和美洲當地人的后代，他們深知祖先的毀滅，他們認為在公元后的某一天，又一個紀元將滅亡，所以集體向北遷移，并在之后的某一天，集體跳入大西洋，逃避世界的滅亡。當然，這一說法還有待論證。

　　20世紀80年代末，一支包括考古學家、動物學家和營養學家在內的共四十五名學者組成的多學科考察隊，踏遍了即使是盜墓賊也不敢輕易涉足的，常有美洲虎和響尾蛇出沒的危地馬拉佩藤雨林地區，用了六年時間對約二百多處瑪雅文明遺址進行了考察，結論是：瑪雅文明是因爭奪財富及權勢的血腥內戰，自相殘殺而毀滅的。

　　這些學者認為，瑪雅人并非是傳說中那樣熱愛和平的民族，相反，在公元300 年至700 年這個全盛期，毗鄰城邦的瑪雅貴族們一直在進行著恐怖的爭權奪利的戰爭：戰卒們用矛和棒作兵器，襲擊其他城市，其目的是抓獲俘虜，并把他們交給己方祭司，作為向神獻祭的禮品。這種祭祀正是瑪雅社會崇拜神靈的標志。

　　瑪雅社會一度相當繁榮，農業、手工業以及商業貿易都非常發達，但自公元7世紀中期開始，瑪雅社會衰落了。戰爭永無休止，生靈涂炭，貿易中斷，城毀鄉滅，最后只有10%的人幸存下來。

　　公元761年，杜斯·彼拉斯城的王宮覆滅可視為瑪雅社會衰落的一個起點。杜斯·彼拉斯是方圓一千五百英里內的中心城邦。它遭到從鄰近托瑪瑞弟托城來的敵人的攻擊，隨后是斬草除根的大屠殺。勝利者舉行了“終結典禮”，砸爛了王座、神廟和刻板。一些貴族逃到附近的阿瓜迪卡城———這是一個巨大裂縫環繞的天然要塞。他們在那里茍延殘喘了四十年，最后還是遭到滅頂之災。公元800 年，阿迪卡已是一座鬼城。公元820年以后，瑪雅人舍棄了這片千年間建立了無數城市的佩藤雨林，再也沒有返回這片文明的發源地。

　　據科學家最新研究顯示，促使瑪雅文明沒落沒落的罪魁禍首可能是干旱，而且這種干旱具有某種時間規律性，與太陽活動的周期有關。

　　太陽活動的周期事實上變動的幅度大約僅有百分之一，但卻足以造成瑪雅文明的心臟地帶———尤卡坦半島嚴重的干旱發生。從來自北尤卡坦奇強卡納普湖采集而來的沉積物中，研究者發現高濃度硫酸鈣沉積層周而復始地出現，硫酸鈣的成因是大量的水分從地表蒸發后而留下的，相隔的時間大約為兩百年，也就是說大約兩百年左右尤卡坦半島上會出現一次嚴重的干旱，這與目前已知的太陽活動的周期長度為二百零六年非常吻合。

　　科學家將瑪雅文明的發展與太陽活動的周期一起研究比較發現，每次遇到干旱發生瑪雅社會文明的發展便有趨緩的現象。而瑪雅人又是非常依賴降雨以及地表水源生活的，長期嚴重的干旱足以使他們的文明中斷并最終滅亡。每一種說法都似乎很有道理，但正如法國人克羅齊所說，“任何歷史都是當代史”，每一種說法也都無可避免地帶上了研究者個人的烙印。瑪雅文明的消失，不可能只是一種成因的單獨作用，撇開外星移民、集體投海等等看起來荒誕不經的推測，農民起義、人口驟降、資源匱乏、地力衰竭、環境惡化、叢林侵蝕等等，這些因素都可能發生作用。至少現在，還沒有人揭開瑪雅文明終結之謎。